后来这起事件被合众方面解释为一场意外。
原因在于信息差。
哥斯拉放出强烈的辐射干扰江户全境、甚至上冲GPS卫星信号，使得合众失去对这怪兽的直接监控。当其原子热线跨越数百公里的海湾，将合众的驻和舰队中央航母直接击沉以后，这消息让所有昏昏欲睡的人好像脑袋上被泼了几桶凉水。
当时的情报在两分钟内上报完成，文件在五分钟内就已放在合众最高总统的桌上。
“真是有意思……不是吗？登上陆地的怪兽哥斯拉正在以超乎想象的热线攻击破坏江户。”
和国是夜晚，地球的另一边还是白昼。
一位高大、黝黑且纤瘦的人类男性在这人类权力最巅峰的位置上，低垂他自己缝隙般的眼睛。
谁也看不清他的表情，谁也不知道他究竟在想什么。
但在他的带领下，确实、合众再度捡回了世界第一的位置。
只见接下来他就举起他的拳头，下达他的通知，按下他决定的按钮，且爽朗微笑：
“那就向它发射我们的导弹罢！我们、反击！”
命令立刻传达下去。
接着，他话语一转，轻声道：
“秘书，把我的新医生安布罗斯·德克斯特喊来，我最近失眠了，我需要再问问。”
世界的事情外，他更关心他自己的事情。
合众所发射的导弹在民间被称为N2洲际导弹。
N2即是No Nuclear（无核）的意思，使用名为全氮阴离子盐的新型材料，无核污染，但中心能量爆发密度足以匹敌核弹，人类目前最高强度的常规性战术武器。
考虑到哥斯拉可能会进行原地反击，于是近岸核潜艇在发射的方向被否决了。
发射地点被敲定为亚美利加洲中西部无人荒漠一军事用基地。
N2洲际导弹从该处抵达和国江户所需要的时间只要十分钟。
第一次非实验性质的战术性启用，其目标范围即是原本测定的哥斯拉方位，并安装有纵然是强烈干扰环境下，也可以进行光谱（红外线与可见光谱）索敌的装置……且早在总统特使访问和国内阁时候，就已经进行了对于超大型活体目标的重新校准。
尽管本身制导偏转的角度有限，但最高当量N2洲际导弹的爆炸范围极其巨大，中央高热区域也足以覆盖哥斯拉。
发射前后，新的不明生物出现的情报才摆上去。
那叫做肖格阮·侯赛因的黑人总统就看了那情报一眼，还是原来那般的微笑：
“不必更改，按原定计划执行。”
然后他就继续与他的医生小声交谈。
事实上，这时，N2洲际导弹已经发射出去。
这样，十分钟后，也是N2洲际导弹最后到达的时间，刚好就是锡安的光线压倒哥斯拉的一瞬。
巨人的感知灵敏到了不可思议的境地，锡安立刻停下哉佩利敖光线。
“这是什么东西？”
超越人类的思维能力一念万转。
他不知道这到底是什么，于是只能按过去的知识所知的最恶劣的可能——核弹来考虑。
“我……应该不怕核弹？”
哥斯拉的原子热线的威力更在核武器之上，其精准扫射的尖端已经刷新了人类所知太阳系内有史以来最高温度的上限。
奥特思索里，锡安转念：
“但他们会怕！”
绝大多数的人都藏在人防核避难所中。
除了被原子热线破坏了承重结构而几近塌陷的地铁站。若非是锡安及时巨大化，并将上层建筑一举抛向外界，里面没有任何人可以活下来。
锡安抬头，在不到一秒的时间里锁定导弹的位置。
“……那就把它踢回去！”
在接近到数百米内的时候，锡安飞起一脚，与N2洲际导弹接触，并向着太空的方向使力。
也就是这时候，哥斯拉突然再度睁开眼睛。
因为哉佩利敖光线的戛然而止，而勉强保下了自己的命。
接着它的背部放射出一条细细的光线向着天空穿破了N2洲际导弹。
瞬间将其引爆。
于是就在这半空之中，火焰烧出了绚烂之极的光。江户的空气发出爆破的尖啸。
熊熊烈焰下沉地表，一路吞没房屋与建筑，直至与哥斯拉造成的大火融为一体，像是长满野火的火原。腾腾烈火上冲天宇，最终向着四面八方爆延，纵然太空也清晰可见，犹如在黎明前的尽头、一颗夜中开花的树。
落英缤纷。
无数的火花与火星，沿着螺旋的轨迹，在暴风中飞旋飘落，落在藏在人类之中的异类的手心之上。
哥斯拉的背脊几乎能够忍受一切高温，它故意引爆N2爆雷，就是为了借助这股巨大的能量重新激活自身的聚变反应，然后开始踉踉跄跄地往海边走去。
江户上空的空气被火焰烧尽，让哥斯拉体内的空气聚变反应更加难以进行。
它的身体非常虚弱了。
但在这里，还生存着的人不关心哥斯拉，只关心巨人。
烟雾迷蒙，发热的世界，扭曲的星空。
“巨人……他被直击了。”
即便是TPC特别作成的运输机也要在冲击波中震荡不已，向着外侧夸张地翻转，在特选的驾驶员精湛的技术之下勉强稳住。
居间惠失色，她趴在窗户上，紧紧盯着这颗正在盛放的树。
“为什么会这样……？”她揪紧自己的头发，垂下了头，不能理解这种事情的发生，“为什么会变成这样……？”
“不是的，不是，可能和队长你想象的情景不太一样……队长，你快看啊！”
宗方又是激动不已，又是感到恐怖，倒跌几步，一直倒在客机另一侧的椅子上，脑袋撞到窗口。
居间惠闻言抬头。
于是她就看到了……
在那盛放的爆炸之中缓缓走出的巨人。
一尘不染，与被爆炸吞没之前的样子一模一样。
于那盛放的火焰之中，极目远眺。
原本天边正要黎明，乳白色的狭带已在衬映深蓝的天空，现在，大量的火花飞向天空，一片焦热。
人们还不知晓名字的巨人，立在化为废墟的城市里，像是一座巍峨的雪山，彰显着其非凡的强韧。
接着，他们又听到了哥斯拉低沉的吼叫，犹如来自炼狱的歌声。
那怪兽还在行动，早已穿过人类文明的废墟，直至东京湾的海岸前。但它在这火势的边缘，反倒忽然力尽而止步，只能凝望无垠的海，最终合上了眼帘。
但它身体却在继续发生惊人的变化。
锡安看到它的尾巴不停分叉、像是一座杂乱的矮灌木丛，每根枝上又塌出数个浅洞来，其轮廓不停抽丝形成诸多怪异的曲线，最终一一闭合，形成诸多的圆形体。而其中有一个成型最快、尤其清晰。
“那是什么……？”
那是哥斯拉在经受过巨人与N2爆雷以后，发生的……新的进化。
电磁脉冲与核辐射都开始减弱。海上的无人机摄像了哥斯拉，向大后方传递照片。
代表美方驻TPC行动的加代子看到照片后，猛地站起，又强忍着颤抖，一手紧抓扶手，一手捂住自己的脸，忍住自己想要呕吐的冲动。
照片中是三个空洞，排列成眼睛与嘴的三个位置。
没有眼珠，也没有牙齿。
是三个黑漆漆的洞。
“那是脸、人脸……那就是牧悟郎元教授的脸啊！难道说、难道说……”加代子突然想到一个最糟糕的可能，“这只哥斯拉个体在第一形态时将当初接触并杀死的人类的基因吸收了吗？”
当初合众生物调查机关的人是亲自下潜到接近海底的地方，然后……全部死在了这体哥斯拉的手里。
传回消息的是上浮的黑匣子。
真哥斯拉具有未知的第五种形态，但在故事里并未展现出来。
这是锡安曾经听说过的事情。
但在现在这种情况下，哥斯拉无法抑制自己进化的发生，又无法有效地进行聚变反应，反倒让自己的能量衰竭耗尽。
最终就在它出生的大海前忽然止步宕机，陷入前所未有的虚弱状态。
锡安迈步，走向前去，决意将其彻底消灭。
可就是这个时候，居间惠突然收到了命令。
“总监……？”
杂音之中，确实是泽井总监的声音。
他是TPC的创始团队之一，即将退居二线。
“居间队长，我希望你能和巨人交谈、保住哥斯拉，那个巨人绝对是有智慧的，TPC的船只与队伍都已经过来了……一个停止行动的哥斯拉对我们是有用的。我们可以让其休眠。”
泽井总监是值得居间惠相信的TPC高层。他现在不知怎的，话语特别疲惫。
“是普罗米修斯工程连那东西也想要剖析研究吗？”
居间惠立刻想到那个活体生物研究组织。
“不是普罗米修斯工程，那不归TPC管……是TPC内部协商的结果……我很难解释，请原谅我……我知道哥斯拉对人类造成了深重的伤害，也知道和这么一个恐怖的生物交谈是多么困难的一件事情。”
驾驶员也接到了命令，他选择直接转向。
“不必说了，总监。我已经理解到TPC的想法了。”
而这飞行的短暂的时间里，居间惠沉默了很久：
“但我要说明的是我并不能左右巨人的意见，他是人类的恩人……他要做什么是他自由的事情。我们可以选择坦然接受，也可以选择反抗。只要TPC、只要人类承担起这个后果。我们和他都是自由的，而他现在可能非常愤怒——我说完了。”
“我也明白。”
居间惠就挂断了通讯，深深呼吸了一口气。
于是，锡安看到TPC的客运机缓缓下降一直到停止行动的哥斯拉的头顶。而远处，大量的船只正在靠近。
多年以后，居间惠也好，宗方也好，无名的驾驶员也好，还有正在赶来TPC的成员，他们大多活着，也有很多已经死了。活着的也还都在与怪兽奋战的第一线。
在那生与死恐怖的边缘，他们也都可以想起这个时刻、这个改变了地球的、人类的、巨人的、还有他们自己的命运的时刻。
持续上万年的、孤独的人类文明在此刻屏住呼吸、不敢异动；人类熟悉的历史更已走向尽头。
居间惠记得最清楚。
在那时候，火焰已经缓缓熄灭，文明的废墟一片焦黑。
巨人走向前来，而黎明的光正照在巨人的身上。
水上是群船鸣响笛声，船后是一轮太阳正在升起。
不知不觉，天亮了。